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　　尽管李嗣涔很强调台大在专业领域的权威地位，但他对学界的交流合作，仍持开放心态，尤其对两岸的学术互动。据他透露，按台大的规划，目前与大陆高校的合作，时机成熟即将招收研究生来台大就读，前期以硕士生和博士生为主，如果一切顺利没有什么问题了，就可以招收大学生来台就学。
　　在此方面，李嗣涔肯定了马英九政府对两岸学术交流的政策。他说，目前台湾大学与北京大学、复旦大学、厦门大学、山东大学等多所大陆著名学府已有交换生的安排，他相信，未来大陆到台湾读书的学生会不断增加。
　　“台湾十分缺乏高科技人才，如果台湾本地现成就有大量高科技人才，为什么还需要到外地去寻找呢？多些异地性的交流，多些全球性交流，对台大巩固自己应有的学术地位有好处。”李嗣涔对此观点明确。
　　
　　 文化积淀，“一切需要时间检验”
　　“打造名校品牌的第五个要素，那就是文化的积淀。”李嗣涔强调说，“品牌代表着高校良好的办学质量，代表某种成功的文化气质，预示学生今后的社会地位，昭示着高校悠久的历史，是高校经年积累的一种优质教育资源，也是事关自身长足发展的一种软实力。”
　　“从广义的角度来看，高校品牌是高校的名称、标志和为教育消费者提供教育服务，培养教育消费者的各要素的总和，是外延和内涵的统一。”李嗣涔做出专业的解释。
　　高校的品牌战略，是通过对学科设置、管理体制、人力资源配置、校园文化的培养等一系列策略的实施，提高自身的核心竞争力，培养自己的品牌资产。尤其是名校的形成除了学生的培养质量外，还需要长期的校园文化积淀，需要深厚的学校文化底蕴支持，而这一切都要时间的检验。
　　对此，李嗣涔认为，一所大学的气质塑造直接影响学生的成才情况，在他心目中，一个合格的学生首先要有扎实的文化底蕴和良好的人格及品德。
　　针对目前冒出来的许多定量的对大学的排名体系，李嗣涔觉得难免会有偏颇，“对于这些排名体系，我们不能太认真，否则就容易产生偏向。我们采取的原则是不管你用什么指标，我们都在追求全面性的进步。高校的品牌文化是依靠长久积淀的，并非几项指标所能概括的。”